לימוד גמרא הוא מעצם טיבו דיאלוגי ומשתף. אין הוא מתיישב היטב עם התבנית של שיעורים פרונטליים ארוכים, והוא מיטיב להתיישב על הלב ועל הדעת כאשר הלומדים הצעירים פעילים באופן אקטיבי בהבנה ובלימוד. באופן הזה התובנות הפדגוגיות החדישות הולמות את רוחו של בית המדרש הנושן, שבמרכזו הלימוד בחברותות. בישיבת הר עציון לצעירים אנו מעמידים במוקד את הלימוד העצמי המודרך. הניסיון מראה שבדרך זו גם תלמידים צעירים מגיעים תוך זמן קצר יחסית להישגים גבוהים, לאהבת תורה ולידיעת התורה.

מרקם החיים של קהילת הישיבה – תלמידים, מורים והורים – נבנה סביב לימוד תורה וחיי תורה. אנו מחנכים את תלמידינו ליראת שמים לא בהטפות ולא בדיבורים, אלא בקיום משותף סביב הציר המרכזי של עבודת ה'. קצב החיים של הישיבה נגזר מלוח השנה של תורת ישראל ומצוותיה. אנו שמים דגש על התפילה המשותפת, שמרגילה את תלמידינו לתפילה משמעותית בציבור.